1） 重点实验室学术委员会
    其职责是：负责实验室研究领域、学科方向布局；项目立项及成果评价；学术交流等。实验室学术委员会产生办法：由所外著名专家和所内专家组成。所外专家由重点实验室在全国范围聘请，所内专家由广州能源研究所主要学术骨干无记名选举产生。产生实验室学术委员会主任1名，副主任1名，学术秘书2名；主任、副主任、学术秘书每一届任期2年，最多连任一届。

2） 重点实验室管理委员会
    其职责是：全面负责实验室建设阶段的规划、布局、审核、实施；实验室建成后的日常管理与监督；科研、成果转化、产业化各独立核算单元的财务管理；成果、宣传与汇报。
重点实验室管理委员会产生办法：由广州能源所主要学术骨干和行政管理骨干无记名选举产生，产生实验室主任1名，副主任2名，秘书2名；主任、副主任、秘书每一届任期2年，最多连任一届。

3） 基本管理单元——首席科学家研究团队
    各团队有明确的学科方向和“三性”目标，各设首席科学家1名，研究主任1~2名，高级助理和研究助理若干名。高级助理以上岗位不超过团队人数的50%。
    实验室对人员实行动态定位，实行“按需设岗，逐级聘任，竞争上岗，强化考核，侧重绩效，优胜劣汰，动态更新，签约管理”的合同聘任机制；实行相对固定的骨干岗位和流动岗位相结合，专职与兼职相结合的用人机制；建立与实际贡献直接挂钩的绩效工资制度和考核制度，实行按岗定酬、按任务定酬、按业绩定酬的分配制度，以实现目标管理、高酬严考、滚动发展。